Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Gtf3c6Q9D8P7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Gtf3c6Q9D8P7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Gtf3c6Q9D8P7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Gtf3c6Q9D8P7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Gtf3c6Q9D8P7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c6Q9D8P7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Gtf3c6Q9D8P7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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