Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpl4Q9D8E6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms