Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Jam3Q9D8B7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms