Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmigd1Q9D7L8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmigd1Q9D7L8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms