Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tube1Q9D6T1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tube1Q9D6T1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms