Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms