Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atad1Q9D5T0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms