Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc130Q9D516 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc130Q9D516 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms