Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc83Q9D4V3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc83Q9D4V3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms