Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931428L18RikQ9D4S9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931428L18RikQ9D4S9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms