Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam90a1bQ9D4F3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam90a1bQ9D4F3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam90a1bQ9D4F3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam90a1bQ9D4F3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam90a1bQ9D4F3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms