Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UvssaQ9D479 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UvssaQ9D479 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UvssaQ9D479 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UvssaQ9D479 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UvssaQ9D479 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UvssaQ9D479 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UvssaQ9D479 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UvssaQ9D479 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UvssaQ9D479 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UvssaQ9D479 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UvssaQ9D479 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UvssaQ9D479 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UvssaQ9D479 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UvssaQ9D479 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UvssaQ9D479 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UvssaQ9D479 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms