Protein–RNA interactions for Protein: Q9D413

Sh2d6, SH2 domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d6Q9D413 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d6Q9D413 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d6Q9D413 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms