Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
4933428G20RikQ9D3X4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms