Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef12Q9D2F1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms