Protein–RNA interactions for Protein: Q9D260

9230112D13Rik, RIKEN cDNA 9230112D13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230112D13RikQ9D260 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
9230112D13RikQ9D260 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9230112D13RikQ9D260 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms