Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms