Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms