Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hddc3Q9D114 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Hddc3Q9D114 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hddc3Q9D114 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hddc3Q9D114 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hddc3Q9D114 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hddc3Q9D114 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Hddc3Q9D114 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hddc3Q9D114 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hddc3Q9D114 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hddc3Q9D114 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Hddc3Q9D114 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hddc3Q9D114 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hddc3Q9D114 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Hddc3Q9D114 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hddc3Q9D114 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Hddc3Q9D114 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Hddc3Q9D114 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Hddc3Q9D114 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Hddc3Q9D114 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hddc3Q9D114 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hddc3Q9D114 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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