Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ifitm1Q9D103 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ifitm1Q9D103 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ifitm1Q9D103 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ifitm1Q9D103 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ifitm1Q9D103 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ifitm1Q9D103 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ifitm1Q9D103 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ifitm1Q9D103 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ifitm1Q9D103 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ifitm1Q9D103 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ifitm1Q9D103 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ifitm1Q9D103 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ifitm1Q9D103 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ifitm1Q9D103 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ifitm1Q9D103 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ifitm1Q9D103 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifitm1Q9D103 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifitm1Q9D103 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifitm1Q9D103 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifitm1Q9D103 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifitm1Q9D103 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifitm1Q9D103 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ifitm1Q9D103 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ifitm1Q9D103 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms