Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms