Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zbed3Q9D0L1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zbed3Q9D0L1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms