Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NkapQ9D0F4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NkapQ9D0F4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NkapQ9D0F4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms