Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc18Q9CZJ9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc18Q9CZJ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc18Q9CZJ9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc18Q9CZJ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc18Q9CZJ9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc18Q9CZJ9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajc18Q9CZJ9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc18Q9CZJ9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc18Q9CZJ9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms