Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl35Q9CZ49 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl35Q9CZ49 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms