Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prelid3bQ9CYY7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms