Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc1r1Q9CYQ5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc1r1Q9CYQ5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms