Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl11Q9CXW4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl11Q9CXW4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms