Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm8Q9CXT6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm8Q9CXT6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms