Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Sgo1Q9CXH7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Sgo1Q9CXH7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Sgo1Q9CXH7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Sgo1Q9CXH7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Sgo1Q9CXH7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sgo1Q9CXH7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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