Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed5Q9CXE7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed5Q9CXE7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms