Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms