Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbm8aQ9CWZ3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm8aQ9CWZ3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm8aQ9CWZ3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms