Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxxc1Q9CWW7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms