Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx28Q9CWT6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms