Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gnpda2Q9CRC9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gnpda2Q9CRC9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms