Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CRC3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CRC3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CRC3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms