Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700029F12RikQ9CRB4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms