Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5sQ9CRA7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms