Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klhl28Q9CR40 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl28Q9CR40 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms