Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR22

Tmem42, Transmembrane protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem42Q9CR22 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem42Q9CR22 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem42Q9CR22 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms