Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PsenenQ9CQR7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms