Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms