Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rwdd1Q9CQK7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rwdd1Q9CQK7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms