Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms