Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ergic3Q9CQE7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic3Q9CQE7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms