Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Asf1aQ9CQE6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Asf1aQ9CQE6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms