Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nipsnap3bQ9CQE1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms