Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg3Q9CPX6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg3Q9CPX6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms