Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rpl17Q9CPR4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms